Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK2P49760 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK2P49760 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK2P49760 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLK2P49760 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK2P49760 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK2P49760 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK2P49760 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK2P49760 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK2P49760 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms