Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALDH1A3P47895 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH1A3P47895 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms