Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GALR1P47211 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GALR1P47211 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GALR1P47211 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GALR1P47211 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALR1P47211 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALR1P47211 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALR1P47211 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GALR1P47211 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GALR1P47211 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GALR1P47211 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GALR1P47211 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms