Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YDR090CYDR090C 933 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 DSE2YHR143W 978 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 YKL202WYKL202W 582 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 NNT1YLR285W 786 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 SHH3YMR118C 591 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 MCA1YOR197W 1299 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 SUS1YBR111W-A 291 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 FRM2YCL026C-A 582 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 EBS1YDR206W 2655 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 GPI1YGR216C 1830 nt3.93□□□□□ -1.78
VID28P40547 RAD2YGR258C 3096 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 SHQ1YIL104C 1524 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 FMP32YFL046W 624 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 YGL082WYGL082W 1146 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 YGL188CYGL188C 174 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 OCA2YNL056W 594 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 YPT53YNL093W 663 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 RCN2YOR220W 798 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 STP1YDR463W 1560 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 MTR4YJL050W 3222 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 ISM1YPL040C 3009 nt3.92□□□□□ -1.78
VID28P40547 NOP12YOL041C 1380 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 snR5snR5 204 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 YDR018CYDR018C 1191 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 YHL026CYHL026C 948 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 LRP1YHR081W 555 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 GTT2YLL060C 702 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 YMR254CYMR254C 309 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 CUR1YPR158W 759 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 APD1YBR151W 951 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 RNR1YER070W 2667 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 PSP1YDR505C 2526 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 NUP60YAR002W 1620 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 ATG21YPL100W 1491 nt3.91□□□□□ -1.78
VID28P40547 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt3.9□□□□□ -1.78
VID28P40547 HMRA1YCR097W 381 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 DAD1YDR016C 285 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 AIM25YJR100C 984 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 SRP21YKL122C 504 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 INN1YNL152W 1230 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 YNL203CYNL203C 612 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 ATP19YOL077W-A 207 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 RPL18AYOL120C 561 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 CMD1YBR109C 444 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 DPB3YBR278W 606 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.9□□□□□ -1.79
VID28P40547 DAN4YJR151C 3486 nt3.89□□□□□ -1.79
VID28P40547 PRP22YER013W 3438 nt3.89□□□□□ -1.79
VID28P40547 PAI3YMR174C 207 nt3.89□□□□□ -1.79
VID28P40547 RUF22RUF22 515 nt3.89□□□□□ -1.79
VID28P40547 IDH2YOR136W 1110 nt3.89□□□□□ -1.79
VID28P40547 SYO1YDL063C 1863 nt3.89□□□□□ -1.79
VID28P40547 MSR1YHR091C 1932 nt3.89□□□□□ -1.79
VID28P40547 VIP1YLR410W 3441 nt3.89□□□□□ -1.79
VID28P40547 UPF3YGR072W 1164 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 SLX9YGR081C 633 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 YGR290WYGR290W 444 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 ANB1YJR047C 474 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 YET1YKL065C 621 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 YKL070WYKL070W 510 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 BUR2YLR226W 1188 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 TOA1YOR194C 861 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 YPR170CYPR170C 336 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 DUN1YDL101C 1542 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 EXO5YBR163W 1758 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 CHK1YBR274W 1584 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 PKH1YDR490C 2301 nt3.88□□□□□ -1.79
VID28P40547 YCR001WYCR001W 315 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 RVS161YCR009C 798 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 BTT1YDR252W 450 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 SLD5YDR489W 885 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 SPT4YGR063C 309 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 RPA12YJR063W 378 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 YKL069WYKL069W 543 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 ECM4YKR076W 1113 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 ILV5YLR355C 1188 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 YBL028CYBL028C 321 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 PET123YOR158W 957 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 SUC2YIL162W 1599 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 VID27YNL212W 2349 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 MDM36YPR083W 1740 nt3.87□□□□□ -1.79
VID28P40547 NDC80YIL144W 2076 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 APC5YOR249C 2058 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 JJJ1YNL227C 1773 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 FRE4YNR060W 2160 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 URA2YJL130C 6645 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 YDL163WYDL163W 303 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 YEL075CYEL075C 369 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 YFL015CYFL015C 495 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 YLL044WYLL044W 447 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 PBA1YLR199C 831 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 ALG8YOR067C 1734 nt3.86□□□□□ -1.79
VID28P40547 ITT1YML068W 1395 nt3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms