Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX2P40425 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PBX2P40425 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PBX2P40425 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PBX2P40425 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PBX2P40425 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX2P40425 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX2P40425 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX2P40425 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX2P40425 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX2P40425 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX2P40425 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PBX2P40425 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX2P40425 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX2P40425 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PBX2P40425 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PBX2P40425 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms