Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK1P39086 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms