Protein–RNA interactions for Protein: P35725

YKL063C, Uncharacterized protein YKL063C, yeast

Predictions only

Length 167 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	P35725	RPL20A	YMR242C	519 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	INO4	YOL108C	456 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	IRC13	YOR235W	315 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	DPB3	YBR278W	606 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	NMD2	YHR077C	3270 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	DSE1	YER124C	1722 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YNL011C	YNL011C	1335 nt		2.64	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	FKH2	YNL068C	2589 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	VHR2	YER064C	1518 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	NTO1	YPR031W	2247 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	PEX14	YGL153W	1026 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YGR293C	YGR293C	462 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	THP2	YHR167W	786 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	VPS25	YJR102C	609 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	CSM3	YMR048W	954 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	SAM37	YMR060C	984 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YMR099C	YMR099C	894 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	FYV6	YNL133C	522 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	FMP41	YNL168C	780 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YOR387C	YOR387C	621 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	ACM1	YPL267W	630 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	MDM1	YML104C	3384 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	GCD2	YGR083C	1956 nt		2.63	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	PEX6	YNL329C	3093 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	AVT5	YBL089W	1380 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	MED1	YPR070W	1701 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	TAF2	YCR042C	4224 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	DTD1	YDL219W	453 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	AI3	Q0060	1248 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YIL174W	YIL174W	228 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YJL222W-A	YJL222W-A	228 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	NNF1	YJR112W	606 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	BOS1	YLR078C	735 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	SUB1	YMR039C	879 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YNL203C	YNL203C	612 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	RIX1	YHR197W	2292 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	POL4	YCR014C	1749 nt		2.62	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	SIR3	YLR442C	2937 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	snR68	snR68	136 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	RGI1	YER067W	486 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YHL005C	YHL005C	393 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	HTD2	YHR067W	843 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	COX23	YHR116W	456 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YML090W	YML090W	387 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	TSR4	YOL022C	1227 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	TPT1	YOL102C	693 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	BI3	Q0115	1554 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	EPL1	YFL024C	2499 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	CWH41	YGL027C	2502 nt		2.61	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YGL177W	YGL177W	348 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	MRPL9	YGR220C	810 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	MRPL38	YKL170W	417 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	PRM6	YML047C	1059 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	MRPL33	YMR286W	261 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	EAP1	YKL204W	1899 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	GYP7	YDL234C	2241 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	VPS30	YPL120W	1674 nt		2.6	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YCR016W	YCR016W	873 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	UBC9	YDL064W	474 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	HPA3	YEL066W	540 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YGR160W	YGR160W	612 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	CCE1	YKL011C	1062 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	RPL6A	YML073C	531 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	DLT1	YMR126C	1029 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	YNL043C	YNL043C	321 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	SWD3	YBR175W	948 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	SKO1	YNL167C	1944 nt		2.59	□□□□□ -1.99
YKL063C	P35725	CWC22	YGR278W	1734 nt		2.59	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	FRE8	YLR047C	2061 nt		2.59	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	HBT1	YDL223C	3141 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	PSK1	YAL017W	4071 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	RPL13A	YDL082W	600 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	LSM4	YER112W	564 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	ALB1	YJL122W	528 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	YKL070W	YKL070W	510 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	RPL6B	YLR448W	531 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	PDR17	YNL264C	1053 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	RPA190	YOR341W	4995 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	PEX5	YDR244W	1839 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.58	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	NET1	YJL076W	3570 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	VAC14	YLR386W	2643 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	TMA64	YDR117C	1698 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	BUD26	YDR241W	288 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	YFH7	YFR007W	1062 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	PSF2	YJL072C	642 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	YBR013C	YBR013C	390 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	ATP3	YBR039W	936 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	UBS1	YBR165W	834 nt		2.57	□□□□□ -2
YKL063C	P35725	HEH2	YDR458C	1992 nt		2.57	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.6 ms