Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms