Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDXP35241 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RDXP35241 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RDXP35241 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDXP35241 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDXP35241 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDXP35241 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDXP35241 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDXP35241 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDXP35241 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDXP35241 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDXP35241 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDXP35241 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDXP35241 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RDXP35241 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms