Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXP28300 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXP28300 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LOXP28300 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LOXP28300 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LOXP28300 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LOXP28300 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LOXP28300 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXP28300 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXP28300 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms