Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKCHP24723 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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