Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRR1P24046 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRR1P24046 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms