Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms