Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRZ1P23471 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRZ1P23471 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms