Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MYF6P23409 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MYF6P23409 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MYF6P23409 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms