Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1P21675 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1P21675 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TAF1P21675 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1P21675 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1P21675 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF1P21675 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF1P21675 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF1P21675 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF1P21675 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TAF1P21675 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1P21675 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1P21675 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms