Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM21P19474 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM21P19474 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms