Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD53P19397 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD53P19397 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD53P19397 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD53P19397 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD53P19397 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD53P19397 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD53P19397 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms