Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF3P18847 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF3P18847 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF3P18847 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF3P18847 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF3P18847 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF3P18847 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF3P18847 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF3P18847 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF3P18847 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATF3P18847 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATF3P18847 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF3P18847 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF3P18847 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF3P18847 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF3P18847 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF3P18847 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATF3P18847 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF3P18847 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF3P18847 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF3P18847 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF3P18847 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms