Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL5P13501 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL5P13501 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL5P13501 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCL5P13501 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL5P13501 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL5P13501 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCL5P13501 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCL5P13501 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL5P13501 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL5P13501 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL5P13501 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL5P13501 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL5P13501 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL5P13501 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL5P13501 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL5P13501 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL5P13501 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL5P13501 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL5P13501 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms