Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMIM10L2AP0DMW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMIM10L2AP0DMW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms