Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C8orf88P0DMB2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf88P0DMB2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms