Protein–RNA interactions for Protein: P0CX85

RPL35B, 60S ribosomal protein L35-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35BP0CX85 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.33□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 MCR1YKL150W 909 nt2.33□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 TFA2YKR062W 987 nt2.33□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 RCE1YMR274C 948 nt2.33□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YPL276WYPL276W 438 nt2.33□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 VPS9YML097C 1356 nt2.33□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 AMS1YGL156W 3252 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 PCL2YDL127W 927 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YGR064WYGR064W 369 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YGR168CYGR168C 1131 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YLR290CYLR290C 834 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 TRM112YNR046W 408 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 COQ10YOL008W 624 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 SWR1YDR334W 4545 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 ANR2YKL047W 1551 nt2.32□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 NFT1YKR103W 3657 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 TFC4YGR047C 3078 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YDR250CYDR250C 276 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 SPT15YER148W 723 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 TAN1YGL232W 870 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 NNT1YLR285W 786 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YLR297WYLR297W 390 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 CWC24YLR323C 780 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 SUB1YMR039C 879 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 POS5YPL188W 1245 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 RRP14YKL082C 1305 nt2.31□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YBR259WYBR259W 2067 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YGR067CYGR067C 2415 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 SUL1YBR294W 2580 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 RRT13YER066W 558 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YLR225CYLR225C 1224 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 MFA2YNL145W 117 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 ATP3YBR039W 936 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YPL071CYPL071C 471 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 RPO41YFL036W 4056 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 NSA1YGL111W 1392 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 GCD10YNL062C 1437 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 STN1YDR082W 1485 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 PSP1YDR505C 2526 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YLR001CYLR001C 2589 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YPL150WYPL150W 2706 nt2.3□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 CDC20YGL116W 1833 nt2.29□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 BCK1YJL095W 4437 nt2.29□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 SEN54YPL083C 1404 nt2.29□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 ERV1YGR029W 570 nt2.29□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YIL174WYIL174W 228 nt2.29□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.29□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 JIP3YLR331C 378 nt2.29□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 PDR11YIL013C 4236 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 AVT5YBL089W 1380 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 DNF1YER166W 4716 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 MRP10YDL045W-A 288 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 RRP1YDR087C 837 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 BRR6YGL247W 594 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YGR114CYGR114C 390 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 RSR1YGR152C 819 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YLR339CYLR339C 552 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 YOL114CYOL114C 609 nt2.28□□□□□ -2.04
RPL35BP0CX85 PLM2YDR501W 1566 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YRB1YDR002W 606 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 RTN1YDR233C 888 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 IZH1YDR492W 951 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YGR190CYGR190C 366 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 PET191YJR034W 327 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 TDA8YAL064C-A 381 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YAL069WYAL069W 315 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YPP1YGR198W 2454 nt2.27□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 RNH202YDR279W 1053 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 TIM11YDR322C-A 291 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YIL024CYIL024C 570 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 SAW1YAL027W 786 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YKL066WYKL066W 444 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YMR147WYMR147W 672 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YNL046WYNL046W 519 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 KTI11YBL071W-A 249 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 SSP2YOR242C 1116 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 CBP6YBR120C 489 nt2.26□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 AGE1YDR524C 1449 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 MSB2YGR014W 3921 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 RRG1YDR065W 1098 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 SYS1YJL004C 612 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 SFT1YKL006C-A 294 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 EBP2YKL172W 1284 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YNL018CYNL018C 1839 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 PFF1YBR074W 2931 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 DNA2YHR164C 4569 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YJL132WYJL132W 2253 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 BUB1YGR188C 3066 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 TCB2YNL087W 3537 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YNL193WYNL193W 1677 nt2.25□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YJR061WYJR061W 2808 nt2.24□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 AXL1YPR122W 3627 nt2.24□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 TIM9YEL020W-A 264 nt2.24□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YGL138CYGL138C 1038 nt2.24□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.24□□□□□ -2.05
RPL35BP0CX85 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.24□□□□□ -2.05
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