Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLI1P08151 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLI1P08151 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLI1P08151 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLI1P08151 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI1P08151 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GLI1P08151 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GLI1P08151 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLI1P08151 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLI1P08151 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLI1P08151 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms