Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYMSP04818 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYMSP04818 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYMSP04818 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TYMSP04818 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TYMSP04818 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TYMSP04818 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TYMSP04818 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TYMSP04818 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TYMSP04818 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TYMSP04818 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms