Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VTNP04004 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTNP04004 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTNP04004 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTNP04004 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTNP04004 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms