Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRUB2O95900 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRUB2O95900 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms