Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJB5O95377 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB5O95377 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB5O95377 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB5O95377 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB5O95377 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB5O95377 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB5O95377 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB5O95377 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJB5O95377 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB5O95377 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB5O95377 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB5O95377 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB5O95377 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB5O95377 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB5O95377 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB5O95377 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB5O95377 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB5O95377 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms