Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIF4AO95239 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIF4AO95239 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms