Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLIT2O94813 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLIT2O94813 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLIT2O94813 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms