Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF3O75054 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF3O75054 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms