Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBNO60934 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBNO60934 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NBNO60934 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NBNO60934 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NBNO60934 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NBNO60934 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms