Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMFO60524 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMFO60524 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMFO60524 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEMFO60524 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEMFO60524 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEMFO60524 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms