Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPLO60437 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPLO60437 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPLO60437 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPLO60437 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPLO60437 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PPLO60437 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPLO60437 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PPLO60437 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPLO60437 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPLO60437 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPLO60437 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPLO60437 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PPLO60437 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PPLO60437 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PPLO60437 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms