Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1BO43795 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYO1BO43795 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYO1BO43795 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms