Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSI1O43347 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI1O43347 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI1O43347 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI1O43347 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSI1O43347 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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MSI1O43347 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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MSI1O43347 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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MSI1O43347 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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MSI1O43347 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSI1O43347 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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MSI1O43347 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSI1O43347 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSI1O43347 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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