Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FANCAO15360 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FANCAO15360 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FANCAO15360 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FANCAO15360 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FANCAO15360 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCAO15360 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCAO15360 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCAO15360 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCAO15360 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCAO15360 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCAO15360 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCAO15360 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCAO15360 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCAO15360 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCAO15360 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCAO15360 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCAO15360 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCAO15360 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCAO15360 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCAO15360 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCAO15360 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCAO15360 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms