Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD8O14715 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RGPD8O14715 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD8O14715 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms