Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAP23O00161 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms