Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOLGA8SH3BPF8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA8SH3BPF8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms