Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UPK3BL2E5RIL1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms