Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PATL2C9JE40 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PATL2C9JE40 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms