Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms