Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRXN3Q9Y4C0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN3Q9Y4C0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms