Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1Q9Y3L3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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