Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAN1Q9Y2M0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAN1Q9Y2M0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms