Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NINLQ9Y2I6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NINLQ9Y2I6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms