Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHKBQ9Y259 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHKBQ9Y259 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms