Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF3IP3Q9Y228 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF3IP3Q9Y228 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms