Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNQ9UQP3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNQ9UQP3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms